La LIGUE DE PROTECTION DES OISEAUX de Franche-Comté a pour but d’agir pour l’oiseau, la faune sauvage, la nature et l’homme et de lutter contre le déclin de la biodiversité, par la connaissance, la protection, l’éducation et la mobilisation.
Depuis le 1er janvier 2007, la LPO Franche-Comté, succède au Groupe Naturaliste de Franche-Comté. L'association, reconnue d'intérêt général, se concentre sur l'étude et la protection des oiseaux, des amphibiens, des reptiles, des mammifères et de leurs habitats en Franche-Comté. La LPO Franche-Comté regroupe aujourd'hui plus de 1000 adhérents et une équipe de 12 salariés autour de trois axes fondamentaux: observer, protèger et partager.